WB實(shí)驗(yàn)原理合集
來(lái)源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
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WB實(shí)驗(yàn)(Western Blot,蛋白質(zhì)印跡)是一種用于檢測(cè)特定蛋白質(zhì)在復(fù)雜樣品中存在及其相對(duì)表達(dá)量的分子生物學(xué)技術(shù)其主要步驟為:樣品制備→電泳→轉(zhuǎn)膜→封閉→抗體孵育→>檢測(cè)(顯影和成像)
——常見(jiàn)疑問(wèn)合集
一.Marker
1.什么是Marker ?
Marker是蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn),一些已知分子量的蛋白質(zhì)的混合物,用于指示蛋白質(zhì)條帶的大小??梢灶?lèi)似為一把“尺子”,驗(yàn)證目的蛋白的分子量。
2.Marker的作用是什么?
①指示待測(cè)蛋白分子量
②顯示蛋白在凝膠上的電泳進(jìn)度
③可協(xié)助標(biāo)記加樣順序4)判斷轉(zhuǎn)膜效率
④判斷轉(zhuǎn)膜效率
3.Marker的分類(lèi)
①未預(yù)染Marker:
優(yōu)點(diǎn):非預(yù)染蛋白沒(méi)有附帶染料分子或標(biāo)記分子,指示大小正好是蛋白原本的大小,所以最準(zhǔn)確。
缺點(diǎn):非預(yù)染蛋白Marker在電泳過(guò)程中看不到,電泳結(jié)束后經(jīng)過(guò)蛋白染色后才能起指示作用,無(wú)法在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中起預(yù)示作用。
②預(yù)染Marker:(wb常用)
優(yōu)點(diǎn):肉眼看見(jiàn),可直接觀(guān)察電泳進(jìn)程和轉(zhuǎn)膜是否完全,較為常用。
缺點(diǎn):Marker蛋白跟染料共價(jià)偶聯(lián)導(dǎo)致蛋白分子電泳的遷移效率發(fā)生改變,其指示的分子量不是精確值而有一定誤差。
3 曝光Marker.
在曝光步驟中,可將目的條帶和Marker條帶同時(shí)曝光顯示,減小誤差,并克服了但克服了預(yù)染 Marker 遷移率的改變,但價(jià)格昂貴
4.預(yù)染Marker的選擇:
①分子量范圍
蛋白marker分為低分子量,寬分子量,高分子量幾類(lèi)。根據(jù)需求選擇
②質(zhì)量和穩(wěn)定性
③與膜的親和性
二.轉(zhuǎn)膜
1.轉(zhuǎn)膜的原理
將凝膠中分離的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到與其具有高度親和力的膜上(一般常用pvdf膜),使蛋白后續(xù)更容易與抗體結(jié)合,便于后續(xù)抗體檢測(cè)。
原理:利用電場(chǎng)使帶負(fù)電的蛋白質(zhì)從凝膠向正極移動(dòng),最終附著在膜上。
2.轉(zhuǎn)膜過(guò)程中甲醇的作用
轉(zhuǎn)膜液中甲醇的作用∶
① 增強(qiáng)蛋白質(zhì)與膜的結(jié)合
甲醇能去除蛋白質(zhì)表面的SDS,使蛋白質(zhì)更容易與膜(如PVDF或硝酸纖維素膜)結(jié)合,提高轉(zhuǎn)膜效率。
② 防止凝膠膨脹
結(jié)合,提高轉(zhuǎn)膜效率。
② 防止凝膠膨脹
甲醇能防止凝膠過(guò)度吸水膨脹,保持凝膠結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,確保蛋白質(zhì)有效轉(zhuǎn)移。
③甲醇能改善蛋白質(zhì)從凝膠向膜的轉(zhuǎn)移,特別是對(duì)高分子量蛋白質(zhì)效果顯著。
甲醇激活PVDF膜的作用:
①用甲醇激活PVDF膜,可以將膜從疏水性變?yōu)橛H水性,提高膜對(duì)蛋白質(zhì)的吸附能力。
②甲醇可以減小膜的孔徑,讓PVDF膜的孔徑變小,防止小分子量蛋白質(zhì)在轉(zhuǎn)膜過(guò)程中丟失。
三.封閉
1.孵育一抗體前為什么需要用脫脂牛奶封
閉?
膜具有高蛋白結(jié)合能力,可以結(jié)合任何可用的蛋白,包括用于檢測(cè)的抗體。如果不進(jìn)行封閉處理,抗體可能會(huì)非特異性地結(jié)合到膜上未被樣品蛋白占據(jù)的位置,導(dǎo)致高背景信號(hào)
合到膜上未被樣品蛋白占據(jù)的位置,導(dǎo)致高背景信號(hào)。
封閉的作用
①減少非特異性背景:封閉劑通過(guò)占據(jù)空白位點(diǎn),阻止抗體非特異性結(jié)合,從而降低背景噪音,使條帶更清晰。
②增強(qiáng)特異性信號(hào):有效的封閉可以幫助抗體更專(zhuān)一地結(jié)合到其目標(biāo)蛋白,提高檢測(cè)的特異性。
(脫脂牛奶是最常用的封閉劑,成本低廉且富多種蛋白。但不宜用于磷酸化蛋白檢測(cè),磷酸1蛋自盡量使用BSA)
四.孵育抗體
1.一抗二抗的原理,為什么需要使用二抗?
原理
一抗的作用是特異性識(shí)別目標(biāo)蛋白的某個(gè)抗原表位,這個(gè)過(guò)程是由一抗的可變區(qū)(Fab區(qū))完成的。二抗識(shí)別并結(jié)合一抗的恒定區(qū)(Fc區(qū)),而不是目標(biāo)蛋白本身
2..為什么需要使用二抗?
①二抗可以通用
同一種動(dòng)物來(lái)源的抗體恒定區(qū)是相同的,因此只需要制造一種通用的二抗(如抗免二抗)就可以用于所有由免子產(chǎn)生的一抗,無(wú)論這些一抗識(shí)別的是哪種蛋白。②放大信號(hào)
一個(gè)一抗可以結(jié)合多個(gè)二抗,多個(gè)二抗的結(jié)合帶來(lái)了更多的信號(hào)分子,從而增強(qiáng)目標(biāo)蛋白的信號(hào)。
3..稀釋一抗二抗一般使用什么液體?
因此只需要制造一種通用的二抗(如抗兔二抗),可以用于所有由兔子產(chǎn)生的一抗
3.一抗二抗一般使用什么液體 ?
二抗稀釋配方:PBST/TBST+5% BSA(血清白蛋白),比例 1:5000~60000
(Tween-20可以幫助稀釋的二抗均勻分散,并提高其與目標(biāo)蛋白的結(jié)合。
BSA可以作為阻斷劑,降低非特異性結(jié)合,提高實(shí)驗(yàn)的特異性)
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