做蛋白純化,必須要熟知的一些蛋白酶抑制劑
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺
蛋白酶抑制劑是生物化學和分子生物學實驗中不可或缺的工具,主要用于防止蛋白質(zhì)樣品在提取和純化過程中被內(nèi)源性蛋白酶降解
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蛋白酶抑制劑是生物化學和分子生物學實驗中不可或缺的工具,主要用于防止蛋白質(zhì)樣品在提取和純化過程中被內(nèi)源性蛋白酶降解
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蛋白酶抑制劑是生物化學和分子生物學實驗中不可或缺的工具,主要用于防止蛋白質(zhì)樣品在提取和純化過程中被內(nèi)源性蛋白酶降解。那么常見的蛋白酶抑制劑有哪些呢?以下玉珠隆生物小編將對其進行整理并分享給各位小伙伴,希望對您有所幫助。
一、蛋白酶抑制劑的種類(按抑制的蛋白酶類型分類)
蛋白酶種類繁多,因此沒有一種“萬能”的抑制劑可以抑制所有蛋白酶。通常需要根據(jù)樣本類型和目標蛋白的特性,可選擇幾種抑制劑混合使用。
以下是針對主要蛋白酶類型的常用抑制劑:
1. 絲氨酸蛋白酶抑制劑
作用對象:胰蛋白酶(Trypsin)、胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin)、凝血酶(Thrombin)等。
常見抑制劑:
PMSF(苯甲基磺酰氟):最經(jīng)典、最常用的抑制劑。毒性極大,不穩(wěn)定,在水溶液中會快速失效(半衰期約30分鐘),必須在臨用前從乙醇或異丙醇儲備液中加入。
AEBSF:水溶性更好,毒性低于PMSF,且更穩(wěn)定,常作為PMSF的替代品。
Aprotinin(抑肽酶):一種小分子蛋白質(zhì),可逆地抑制多種絲氨酸蛋白酶。
2. 半胱氨酸蛋白酶抑制劑
作用對象:組織蛋白酶(Cathepsin B, L)等。
常見抑制劑:
E64:高效、特異、不可逆的抑制劑。水溶性好,非常穩(wěn)定。
Leupeptin(亮抑蛋白酶肽):可逆抑制劑,既能抑制部分半胱氨酸蛋白酶,也能抑制一些絲氨酸蛋白酶(如胰蛋白酶)。
3. 天冬氨酸蛋白酶抑制劑
作用對象:胃蛋白酶(Pepsin)、組織蛋白酶D(Cathepsin D)、腎素(Renin)等。
常見抑制劑:
Pepstatin A:一種特異性很強的抑制劑,有效濃度很低(微摩爾級)。難溶于水,通常用甲醇或乙醇配制儲備液。
4. 金屬蛋白酶抑制劑
作用對象:膠原酶(Collagenase)、嗜熱菌蛋白酶(Thermolysin)、多種金屬內(nèi)肽酶等。這類酶活性依賴于金屬離子(如Zn2?)。
常見抑制劑:
EDTA(乙二胺四乙酸)/ EGTA:通過螯合金屬離子(如Zn2?, Ca2?)來抑制酶活,并非直接作用于蛋白酶本身。是最常用的廣譜金屬蛋白酶抑制劑。
1,10Phenanthroline(鄰菲羅啉):也是一種金屬離子螯合劑。
5. 氨基肽酶抑制劑
作用對象:從多肽鏈N端開始水解的蛋白酶。
常見抑制劑:
Bestatin:抑制氨基肽酶B和亮氨酸氨基肽酶。
EDTA:對某些金屬離子依賴的氨基肽酶也有效。
6. 蛋白酶體抑制劑
作用對象:26S蛋白酶體復合物。
常見抑制劑:
MG132:可逆抑制劑,廣泛用于細胞培養(yǎng)研究,以抑制蛋白質(zhì)的泛素化蛋白酶體降解途徑。
Lactacystin:不可逆的特異性抑制劑。
二、使用方法
1. 基本原則:使用多種抑制劑混合物
由于樣本(如細胞、組織)中通常含有多種類型的蛋白酶,強烈建議使用復合型的蛋白酶抑制劑混合物,而不是單一抑制劑。這能確保對各類蛋白酶都有廣泛的抑制效果。
2. 兩種主要獲取方式:
商品化的預混抑制劑:
形式:通常是片劑(溶解于一定體積的裂解液中)或即用型溶液。
優(yōu)點:非常方便,比例經(jīng)過優(yōu)化,廣譜高效,避免了自行配制和稱量有毒試劑的麻煩。市面上有針對通用、哺乳動物細胞、細菌細胞、組蛋白提取等不同需求的專用混合劑。
推薦:對于常規(guī)實驗,這是最省時省力且可靠的選擇。
自行配制:
根據(jù)需要抑制的蛋白酶類型,從上述種類中選擇幾種,用合適的溶劑(如水、乙醇、DMSO等)配制成高濃度的儲備液,然后按比例添加到裂解液或緩沖液中。
優(yōu)點:成本較低,可根據(jù)特定需求靈活調(diào)整配方。
缺點:需自行稱量有毒試劑,優(yōu)化比例較麻煩。
3. 一個常用的基礎(chǔ)自行配制方案(僅供參考):
對于常規(guī)的哺乳動物細胞/組織蛋白提取,比較常用的抑制劑組合是:
PMSF:1 mM (針對絲氨酸蛋白酶)
Aprotinin:0.31 μM或12 μg/mL
Leupeptin:0.55 μg/mL(針對半胱氨酸和部分絲氨酸蛋白酶)
Pepstatin A:1 μM(針對天冬氨酸蛋白酶)
EDTA:0.51 mM(針對金屬蛋白酶)
注意:所有儲備液均需分裝并于20°C保存。PMSF必須在裂解液臨用前加入。
4. 關(guān)鍵步驟和注意事項:
①.預冷:所有操作都應(yīng)在4°C冰上進行,以降低蛋白酶活性。
②. 提前加入:蛋白酶抑制劑應(yīng)在裂解開始前就添加到裂解緩沖液中,確保樣品一接觸裂解液就受到保護。
③. 濃度:遵循產(chǎn)品說明書或文獻建議的濃度,過高濃度可能影響后續(xù)實驗(如蛋白質(zhì)功能研究、免疫沉淀等)。
④. 穩(wěn)定性:注意不同抑制劑的穩(wěn)定性。例如,含有PMSF的溶液應(yīng)在3060分鐘內(nèi)使用。
⑤. 后續(xù)步驟:在純化后期(如透析、柱洗脫)可能需要補充蛋白酶抑制劑,或在后續(xù)步驟中將其去除(如通過透析或脫鹽柱),以免干擾蛋白功能。
⑥. 特殊蛋白:對于磷酸化蛋白研究,需要添加磷酸酶抑制劑(如NaF、β甘油磷酸酯、原釩酸鈉等),因為蛋白酶抑制劑對磷酸酶無效。
⑦. 安全性:許多抑制劑(如PMSF)有劇毒,操作時應(yīng)佩戴手套、護目鏡,并在通風櫥中進行。
小編建議:
對于新手或常規(guī)實驗,直接購買商品化的蛋白酶抑制劑,按說明書添加到裂解緩沖液中。這是最安全、高效的選擇。對于特定需求或大規(guī)模實驗,可以考慮自行配制,但務(wù)必注意安全,并參考文獻優(yōu)化配方。需要牢記的是:低溫操作與提前添加抑制劑是保護蛋白質(zhì)樣品不被降解的兩個最關(guān)鍵因素。
文源自純化大師
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