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最近小編跟《Molecular Cell》雜志杠上了，作為《Cell》的子刊，刊出的文章對于基礎(chǔ)研究實在很有學(xué)習和借鑒意義。

Q：這么愛學(xué)習，為什么不去看主刊？

A：你以為我不想，那是小編這種才情與智慧能看得懂的嗎？？？！

話說回來，都CNS、CNS的講，但《Cell》是生物學(xué)專刊，《Nature》《Science》是綜合期刊，C雖然分值當下不敵N/S，但在生物專業(yè)領(lǐng)域的影響力和認可度要高于NC。

Cell在一個細胞里面講故事，Nature，Science則關(guān)心全宇宙的自然和科學(xué)。

話不多說上文章！

譯：p53負調(diào)節(jié)lncRNA-PRESS1通過干擾SIRT6介導(dǎo)抑制的H3K56去乙?；饔脵C制從而保護胚胎干細胞多能性

從標題看，該文涉及不少熱點話題：

?LncRNA

?組蛋白去乙?；?/span>

?胚胎干細胞（也對復(fù)發(fā)癌癥中腫瘤干細胞的功能有預(yù)測作用）

老規(guī)矩，奉上思路圖。

本文Highlights：

1、p53在人胚胎干細胞分化過程中抑制LncPRESS1表達。

2、LncPRESS1控制著有利于胚胎干細胞多能性的轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)。

3、LncPRESS1可作為誘餌來限制多能性基因啟動子的SIRT6活性。

4、LncPRESS1可通過維持高乙?；絹砜刂迫伺咛ジ杉毎亩嗄苄?。

說人話就是：

p53可結(jié)合于LncPRESS（一個被作者命名的受p53調(diào)節(jié)的胚胎干細胞特異性的lncRNA合集）的啟動子區(qū)，抑制lncPRESS的表達。其中，LncPRESS1是組蛋白去乙?；D(zhuǎn)移酶SIRT6的“分子支架”，可募集SIRT6并將SIRT6與選擇性基因位點隔離，以維持H3K9和H3K56的高乙?；剑Ｕ吓咛ジ杉毎亩嗄苄?。

先針對不太了解胚胎干細胞的小可愛們解釋一下：

【人胚胎干細胞（hESC）】是從人類早期胚胎內(nèi)細胞團分離出來的高度未分化的多能性細胞，具有無限增殖的能力，并經(jīng)過有道可分化為不同類型的組織細胞。因此，人胚胎干細胞做作為立項的實驗材料而應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、藥學(xué)等方面的研究。

【組蛋白修飾】包括組蛋白的甲基化、乙?；⑷ヒ阴；?/span>修飾，及其它修飾如：泛素化、磷酸化，和ADP核糖基化等。在人胚胎干細胞自我更新和分化中起著舉足輕重的作用。

【組蛋白乙?；腿ヒ阴；?/span>組蛋白乙酰化和去乙?；?，分別由組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶（HAT）和去乙?；D(zhuǎn)移酶（HDAC）催化完成。HAT將乙酰輔酶A（acetyl-CoA）的乙?；D(zhuǎn)移至核心蛋白氨基酸末端中特定的賴氨酸殘基上，中和其電荷，使核小體DNA更容易接近于轉(zhuǎn)錄因子，而HAT充當轉(zhuǎn)錄輔激活因子，發(fā)揮基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)的作用。而HDAC則發(fā)揮了與HAT相反的作用，將乙?；鶑暮诵牡鞍啄┒速嚢彼釟埢限D(zhuǎn)出，達到去乙?；哪康摹?/span>

【SIRT6】本文所研究的SIRT6，屬于HDAC成員中的一種，是Sirtuin蛋白家族第6號成員，被公認為可將3號組蛋白K56和K9的賴氨酸殘基上的乙?；鶊F轉(zhuǎn)出，有去乙?；δ?/span>。其在正常細胞中的功能常與細胞分化、衰老有關(guān)；在腫瘤細胞中，常與應(yīng)激下的細胞內(nèi)炎癥反應(yīng)、糖酵解、脂代謝等有關(guān)。

Background：

胚胎干細胞在分化過程中通過染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化，可以引發(fā)特定基因表達程序的表觀遺傳調(diào)控。但染色質(zhì)改變與譜系特異性表觀遺傳程序的執(zhí)行之間的聯(lián)系機制目前還是未知的。

參與胚胎干細胞功能的一個關(guān)鍵的組蛋白翻譯后修飾是組蛋白H3上的K9和K56位點的去乙酰化是由SIRT6介導(dǎo)的，以抑制OCT4、SOX2、αNANOG的表達，并促進胚胎干細胞的分化。然而，限制胚胎干細胞中SIRT6活性以維持H3K56ac/K9ac多能性的機制尚未闡明。

腫瘤抑制因子p53積極參與人和小鼠胚胎干細胞的分化，目前對胚胎干細胞中p53功能的研究主要集中在確定p53介導(dǎo)的蛋白編碼基因的調(diào)控上，對非編碼基因的研究較少。

Results：

Fig 1：P53在胚胎干細胞分化過程中對多個lncRNA的表達進行調(diào)控

作者通過干擾p53與對照組的RNA測序結(jié)果分析，成功得到了52501個轉(zhuǎn)錄本。篩選得到了275個在胚胎干細胞分化過程中有差異表達的LncRNAs。而表現(xiàn)出受p53調(diào)控的有102個。

由于p53在維甲酸誘導(dǎo)處理的胚胎干細胞中被激活，而p53抑制的LncRNA轉(zhuǎn)錄本可能具有多潛能特異性調(diào)節(jié)功能。因此，作者將這些LncRNAs統(tǒng)稱為LncPRESS（Lnc p53 regulated andESC specific）。

蛋白質(zhì)編碼基因的譜系特異性表達與細胞狀態(tài)變化過程中改變的特定表觀遺傳背景相關(guān)系，作者將LncRNA圖譜與人類胚胎干細胞中的活性(H3K4me3)和抑制性(H3K27me3)組蛋白標記進行了整合，發(fā)現(xiàn)基因組范圍內(nèi)的組蛋白修飾平均發(fā)生在lncRNA TSS（轉(zhuǎn)錄起始位點）上游和下游3.5 kb處。在可被p53激活的LncRNA中，H3K27me3在LncRNA TSS上下游共7kb區(qū)域內(nèi)的表達顯著減少，而H3K4me3的增加。而可被p53抑制的lncRNAs的TSS下游H3K27me3的低水平?jīng)]有變化。