
載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)步驟與問(wèn)題解析【附視頻教程】
2021-04-26 20:48:13
來(lái)源/作者:普拉特澤生物-醫(yī)學(xué)整體課題外包
載體構(gòu)建是為了把DNA分子運(yùn)送到受體細(xì)胞中去,必須尋找一種能進(jìn)入細(xì)胞、在裝載了外來(lái)的DNA片段后仍能正常復(fù)制的運(yùn)載體,載體主要有病毒和非病毒兩大類,目前理想的運(yùn)載體是質(zhì)粒。而在基因工程中,常用的載體是人工改造構(gòu)建的質(zhì)粒,載體構(gòu)建即是構(gòu)建含外源DNA的質(zhì)粒。
那么質(zhì)粒是什么?它是指存在于細(xì)菌、真菌等微生物細(xì)胞中、獨(dú)立于染色體外、能進(jìn)行自我復(fù)制的遺傳因子。20世紀(jì)80年代質(zhì)粒被發(fā)現(xiàn),最初發(fā)現(xiàn)的質(zhì)粒均由研究者根據(jù)表型、大小等特征自行命名,如F因子(fertility factor,致育因子)、R質(zhì)粒(resistance factor,抗性質(zhì)粒)和Col質(zhì)粒(colicin,大腸桿菌毒素質(zhì)粒)等。

一個(gè)合格質(zhì)粒的組成要素是什么呢?
1、復(fù)制起始位點(diǎn)Ori,即控制復(fù)制起始的位點(diǎn);
2、抗生素抗性基因;
3、多克隆位點(diǎn) MCS區(qū);
4、P/E 啟動(dòng)子/增強(qiáng)子;

5、Terms 終止信號(hào);
6、poly(A)加尾信號(hào)。
不同載體的實(shí)驗(yàn)步驟(總括)
關(guān)于過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建與干擾載體構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)步驟見(jiàn)下圖,
詳細(xì)的片段獲取與連接方式點(diǎn)此跳轉(zhuǎn)


當(dāng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)無(wú)克隆的現(xiàn)象
可能的原因主要是連接不成功或者連接成功,但轉(zhuǎn)化失敗。具體原因分別如下:
可能原因一:引物設(shè)計(jì)不合理;
解決辦法: 1、設(shè)計(jì)原則:同源臂(15-25bp,GC含量40%-60%)+酶切位點(diǎn)(根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求保留或刪除)+基因特異性引物;
可能原因二:載體與目的片段重組比例不當(dāng);
解決方法: 1、載體和目的片段濃度測(cè)定方法:常用吸光度或瓊脂糖電泳法;
2、載體與目的片段添加比例: ①單片段建議:最適載體與目的片段摩爾比為1:2-1:3;
②多片段建議:最適DNA使用量為每片段(含線性化載體)0.03pmol;
可能原因三:載體與目的片段不純;
解決方法: 1、推薦對(duì)線性載體、PCR產(chǎn)物進(jìn)行膠回收純化;
2、純化產(chǎn)物建議溶解在pH8.0的ddH2O中保存;
3、若為未純化的DNA,加入總體積不超過(guò)反應(yīng)體系體積的1/5;
可能原因四:試劑盒失效或者操作問(wèn)題;
解決方法:建議做試劑盒附帶的陽(yáng)性對(duì)照實(shí)驗(yàn),判斷方法:
1、若陽(yáng)性有克隆并檢測(cè)為陽(yáng)性,則排除試劑盒問(wèn)題;
2、若陽(yáng)性對(duì)照無(wú)克隆,可能是操作問(wèn)題或試劑盒失效。
更多載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)步驟講解點(diǎn)此跳轉(zhuǎn)
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